הונדה CR-Z דורגה כאחת המכוניות הבטוחות ביותר באירופה! כך על פי התוצאות של מבחני הריסוק העצמאיים של ה- Euro NCAP.
שיטת דירוג ה- Euro NCAP החדשה שנכנסה לתוקף בשנת 2009, מבוססת על תוצאה משוקללת המשלבת היבטים רבים של ביצועי הבטיחות של המכונית ובהם: תוצאות בדיקת ההגנה על מבוגרים (50%), ילדים (20%) והולכי רגל (20%) וכן מידת הזמינות של התקני סיוע לבטיחות לנהג (10%). כדי שהם יכללו בתוצאה, חייבים התקני הסיוע לבטיחות (VSA) להיות זמינים ב-90% ממערך דגמי 2010 ב- 27 המדינות החברות באיחוד האירופי.
הונדה CR-Z זכתה במבחנים אלו בדירוג המרבי של 5 כוכבי בטיחות.
ה-CR-Z הינה הדגם האחרון בשרשרת ארוכה של מכוניות הונדה שזכו בציון הגבוה ביותר. מאז הצגת שיטת הדירוג החדשה בחנה Euro NCAP ארבעה דגמים אחרים של הונדה: סיוויק, אקורד, ג’אז ולאחרונה אינסייט. כל חמשת הדגמים זכו בחמישה כוכבים, כאשר האינסייט נבחרה גם כ"מכונית ההיברידית הבטוחה ביותר" וסיימה במקום השני בדירוג הבטיחות הכולל מבין כל המכוניות שנבחנו בשנת 2009.