חשש לניגוד עניינים של יו"ר הוועדת החשמל והתנהלות בלתי תקינה לכאורה בעבודת הוועדה, שעלולה לגרום לפגיעה ביצרני החשמל הפרטיים הביאו את ועדת ביקורת המדינה בכנסת לבקש ולדון בעבודת הועדה.
יו"ר הוועדה, ח"כ אמנון כהן (ש"ס) אומר כי במהלך החודשים האחרונים מתקיימים דיונים במסגרת ועדה בראשות מנהל רשות החברות בעניין מבנה משק החשמל ("ועדת יוגב"), ובשבועות האחרונים מתקיימים מפגשי הועדה ונציגיה עם ועד עובדי חברת החשמל על מרכיבים שונים בהצעת המדיניות המתגבשת. לעומת-זאת, זכה כל אחד מיצרני החשמל הפרטי ל- 40 דקות בלבד להשמעת עמדתו טרם החלה הועדה בדיוניה. "עולה החשש כי יש נטייה ברורה להשפעת יתר על הוועדה - של חברת החשמל וועד עובדיה, ולנסיגה מהמתווה התחרותי שהחל להתגבש, ואף מעוגן בחוק משק החשמל. הועדה אינה מפרסמת את הפרוטוקולים של דיוניה ואף לא תקצירים שלהם, והיא גם לא זימנה לשימוע את הגורמים שעשויים להיפגע בדרך כלשהי מהחלטות הועדה בטווח הקצר או הארוך".
כהן מציין כי "מתוך כל אלו, עלולה להירשם פגיעה חמורה ביצרני החשמל הפרטיים הקיימים, יזמים שהחלו לפעול להקמת תחנות, לא יצליחו לקבל את המימון הנדרש להקמתן ותחנות חדשות אשר כבר קמו, לא יעמדו ביחסי הכיסוי והמודל הפיננסי עליו הן נשענו בעת ההקמה, יקרוס. מונופול חברת החשמל ישוב לשליטה מלאה על כל משק החשמל".