הכנסות אבוג’ן בשנת 2012 הסתכמו בכ-17.1 מיליון דולר, המהווה גידול של כ-15% לעומת הכנסות של כ-14.9 מיליון דולר בתקופה המקבילה אשתקד. הגידול נובע בעיקר מהכנסות בגין הרחבת שיתוף הפעולה עם מונסנטו בסוף שנת 2011. הכנסות החברה ברבעון הרביעי של 2012 הסתכמו בכ-4.8 מיליון דולר, בהשוואה לכ-4.7 מיליון דולר ברבעון המקביל אשתקד. כיום, ההכנסות מבוססות בעיקר על הכנסות משלומי מחקר ומתן רישיונות לגנים במסגרת הסכמי שיתוף הפעולה השונים של החברה עם חברות זרעים.
עלות ההכנסות כוללת הוצאות בגין פעילות מחקר ופיתוח שוטפת של החברה במסגרת שיתופי הפעולה עם חברות הזרעים. הסכמי שיתוף פעולה אלו כוללים, בנוסף להכנסות בגין ביצוע פעילות המחקר והפיתוח כמצוין לעיל, גם הכנסות עתידיות בגין תשלומי אבני דרך ותמלוגים ממכירות זרעים. עלות ההכנסות בשנת 2012 הסתכמה בסך של כ-9.6 מיליון דולר; זאת בהשוואה לסך של כ-8.3 מיליון דולר בתקופה המקבילה אשתקד. הגידול בעלות ההכנסות הינו במקביל לגידול בהכנסות, כמצוין לעיל. עלות ההכנסות ברבעון הרביעי של 2012 הסתכמה בסך של כ-2.6 מיליון דולר; זאת בהשוואה לסך של כ-2.7 מיליון דולר ברבעון המקביל אשתקד.
הוצאות מחקר ופיתוח בשנת 2012, אשר אינן כוללות הוצאות בגין תמיכה בשיתופי הפעולה הקיימים של החברה (הנכללות תחת ’עלות ההכנסות’ כמצויין לעיל), הסתכמו בסך של כ-7.3 מיליון דולר; זאת בהשוואה לסך של כ-6.4 מיליון דולר בתקופה המקבילה אשתקד. הוצאות מחקר ופיתוח ברבעון הרביעי של 2012 הסתכמו בסך של כ-2.1 מיליון דולר; זאת בהשוואה לסך של כ-1.7 מיליון דולר ברבעון המקביל אשתקד. הגידול בהוצאות המחקר והפיתוח לשנת 2012 נובע בעיקר מהגידול בפעילות בחטיבות המוצר החדשות של החברה, מפיתוח טכנולוגיות חישוביות ומערכות ולידציה חדשות וכן מגידול במצבת כח האדם.
ההפסד התפעולי בשנת 2012 הסתכם בסך של כ-3.2 מיליון דולר, ללא שינוי ביחס לתקופה המקבילה אשתקד. ההפסד התפעולי ברבעון הרביעי של 2012 הסתכם בסך של כ-0.9 מיליון דולר, זאת בהשוואה להפסד תפעולי בסך של כ-0.8 מיליון דולר ברבעון המקביל אשתקד.
הוצאות מימון בגין שערוך כתבי אופציה סחירים: נכון למחצית הראשונה של שנת 2011, לאבוג’ן היו כ-4.5 מיליון אופציות סחירות, שהונפקו במסגרת הנפקת החברה בבורסה בתל-אביב במאי 2007, מתוכן 99.9% מומשו עד ליום 31 במאי, 2011 (תאריך פקיעת האופציות). כל עוד האופציות נסחרו, ולמרות שאינן משפיעות על מצבה הפיננסי של החברה, בהתאם לכללי חשבונאות מקובלים, כל שינוי במחיר מניית החברה, נכון לסוף תקופת הדיווח, גרם לשינוי בהכנסות (הוצאות) המימון בגין שערוך כתבי אופציה בדוח הרווח הכולל וכן בהתחייבות בגין כתבי אופציה במאזן החברה. עם מימושן של אופציות אלו במאי 2011, אין אופציות סחירות נוספות, ולכן לא צפוי שינוי נוסף בסעיף זה מעבר לרבעון השני של שנת 2011.
ההפסד הכולל בשנת 2012 הסתכם בסך של כ-2.5 מיליון דולר, בהשוואה לרווח כולל בסך של כ-0.6 מיליון דולר בתקופה המקבילה אשתקד. ההפסד הכולל ברבעון הרביעי של 2012 הסתכם בסך של כ-0.8 מיליון דולר, זאת בהשוואה להפסד כולל בסך של כ-0.9 מיליון דולר ברבעון המקביל אשתקד. ההפסד הכולל לשנת 2012 אינו כולל השפעות של הכנסות מימון שאינן מלוות בתזרים מזומנים, עקב מימוש מרבית כתבי האופציה כפי שמוסבר לעיל, בעוד שהרווח הכולל בשנת 2011, כולל כ-3.7 מיליון דולר בגין הכנסות מימון שאינן מלוות בתזרים מזומנים.
נכון ליום 31 בדצמבר, 2012, יתרות המזומנים, שווי מזומנים והשקעות לזמן קצר הסתכמו בסך של כ-55.1 מיליון דולר, זאת בהשוואה לסך של כ-58.8 מיליון דולר ליום 31 בדצמבר, 2011.