המחלקה המשפטית במשרד התמ"ת, באמצעות עו"ד רונית בן יעקב, הגישה כתב אישום ובו 19 אישומים כנגד מקדונלד’ס, בגין העסקת נערים ביום המנוחה השבועי, וכן בגין ביצוע עבירות של הפרעה למפקחי העבודה במילוי תפקידם. ממצאים אלה התקבלו במסגרת חקירות שניהל האגף לאכיפת חוקי עבודה במינהל ההסדרה והאכיפה במשרד התמ"ת.
מקדונלד’ס העלתה טענות שונות בנוגע לנימוקים להגשת כתב אישום, ובעיקר טענה שקיימים פגמים בהתנהלות משרד התמ"ת המצדיקים ביטול של כתב האישום. החברה טענה כי הופלתה מסיבות רבות, ובכלל זאת רקע דתי. היא הסבירה כי האיסור הנוגע להעסקת בני נוער במנוחה השבועית, נאכף רק כאשר בראש משרד התמ"ת עומד נציג של מפלגה חרדית. בית הדין דחה את טענותיה של מקדונלד’ס לאור טענות המשרד כי גם בתקופת כהונת שרים שאינם נציגי מפלגה חרדית, נאכף החוק וכן כי האיסור על העבדת בני נוער בשבת לא נועד לתכלית דתית, אלא בכדי לאפשר לבני הנוער לחוות את יום המנוחה באופן משמעותי.
מקדונלד’ס העלתה טיעונים רבים כעילה למחיקת כתב האישום כנגדה, בין השאר, טענות בדבר אפלייה על רקע סקטוריאלי ועל רקע גיל הנערים העובדים. עוה"ד אנט שקורי פליישמן, תובעת בכירה במחלקה המשפטית, טענה בפני בית הדין לעבודה כי דין הבקשה להידחות ופירטה את נימוקיה. בית הדין קיבל את עמדתה, דחה את הטענות הרבות שהועלו ע"י הנאשמת וקבע כי למשרד התמ"ת עומדת החזקה כי הוא פועל באופן מקצועי ולא הונחה תשתית עובדתית שיש בה כדי להצביע על חשש למשוא פנים ולהפעלת שיקולים זרים בעניינה של הנאשמת בתיק . בהמשך לכך נותר כתב האישום כנגד החברה על כנו.
עו"ד גלי לוי, התובעת הראשית במשרד התמ"ת, מביעה סיפוק מההחלטה. "הפרקטיקה של העסקת נוער בניגוד לחוק, צריכה להיפסק וככל שמעבידים לא יתאימו את העסקת הנוער להוראות החוק ולהנחיות משרדנו, יינקטו נגדם הליכים פליליים ואף יוגשו במקרים המתאימים כתבי אישום. יובהר כי לאחר מיצוי ההליך הפלילי והרשעת נאשמים התביעה תבקש מבית הדין להחמיר בענישה במסגרת גזר הדין בהתייחס להעסקת נוער שלא כדין על מנת להרתיע מהעסקה פוגענית של נוער המהווה חוליה חלשה בשוק העבודה".