משרד האנרגיה מסדיר את עבודת מכוני המחקר הממשלתיים: הקבינט החברתי כלכלי אישר הבוקר (13.2.17) את הצעת משרד האנרגיה להסדרת עבודת מכוני המחקר הממשלתיים, כך שפעילותם תותאם למדיניות הממשלה ולמטלות השלטוניות, כמקובל במדינות אחרות להן מכוני מחקר ממשלתיים.
מכוני המחקר שעבודתם תוסדר: החברה לחקר ימים ואגמים לישראל (חיא"ל), המכון גיאולוגי, והיחידה הסיסמולוגית של המכון הגיאופיסי שתשתלב במכון הגיאולוגי. המכון הגיאולוגי יחד עם האגף לסיסמולוגיה של המכון הגיאופיסי יפעלו כיחידת סמך תחת המשרד, בעוד חיא"ל תישאר כחברה ממשלתית שהינה זרוע ביצוע של הממשלה, וייחתם עימה הסכם מסגרת רב שנתי לביצוע תכניות עבודה.
במסגרת השינוי הארגוני תקום מועצה מייעצת בראשות המדענית הראשית של המשרד ובשיתוף נציגי אקדמיה, משרדי ממשלה אחרים ובעלי עניין. המועצה תייעץ ותבנה ביחד עם המכונים את תכניות העבודה בהתאם להחלטות הממשלה הרלוונטיות ולמטלות שלטוניות. הדבר יסייע בחיזוק תחומי המחקר הנדרשים לממשלה ולמשק לצורך יישום מדיניותה בטווח הקצר והארוך, וביצירת שיתופי פעולה מקצועיים בין המכונים.
ההחלטה על השינוי הארגוני התקבלה לאחר עבודת מטה אינטנסיבית בהובלת מנכ"ל המשרד שאול מרידור, והמדענית הראשית ד"ר ברכה חלף, ובשיתוף כלל הגורמים הרלוונטיים – מינהל המחקר, המכון הגיאולוגי, חיא"ל, המכון הגיאופיסי, רשות החברות הממשלתיות, נציבות שירות המדינה, משרד האוצר ועוד.